Pour produire efficacement de l'électricité dans un réacteur à fusion magnétique, il faut produire et confiner un plasma chaud pendant une durée suffisamment longue pour que de nombreuses réactions de fusion existent. Les instabilités qui se développent dans le cœur des plasmas confinés magnétiquement font de cette tâche un défi formidable en augmentant le transport de particules et de l'énergie du cœur du plasma vers le bord et/ou en détruisant la topologie magnétique. L'afflux d'ions d'impuretés lourds produits par les parois métalliques entourant le plasma doit également être soigneusement contrôlé pour éviter la dégradation du confinement par les pertes par rayonnement dues à l'émission de raies des impuretés. La compréhension et le contrôle des instabilités magnéto-hydrodynamiques, du transport collisionnel et du transport turbulent dans le coeur du plasma est donc l'une des questions clés de la fusion magnétique.
Dans le cadre des activités de recherche soutenues par l'ISFIN, une attention particulière sera accordée à l'impact de la masse isotopique sur le confinement du plasma (les dispositifs de fusion actuels fonctionnent avec des ions H ou D alors que les futurs réacteurs reposeront sur un mélange D-T) et à la mise au point de modèles réduits nécessaires pour décrire l'évolution et le confinement du plasma dans un cadre de modélisation intégrée.